魂阵阵旗的布置围绕武将定位和魂阵特性展开，优先将攻击类阵旗分配给核心输出武将，防御类阵旗分配给前排坦克。阵旗属性加成为固定比例，例如攻击型阵旗提升10%攻击力，当前版本仅最新解锁的魂阵阵旗生效，优先解锁高阶魂阵以激活更强效果。
魂阵系统在主角达到80级后开启，分为橙魂阵和红魂阵两类，橙魂阵提供2个阵旗位，红魂阵提供4个阵旗位。阵旗类型包括攻击、生命、物防、法防四种，分别对应不同属性的百分比加成。布置时注意阵旗的激活条件，例如红魂阵需消耗安魂石和特定魂灵解锁，而安魂石主要通过制霸骁勇榜和王者争霸活动获取。
布置阵旗时结合武将职能，例如前排盾兵优先装备生命或防御类阵旗，后排谋士或弓手则适合攻击型阵旗。部分魂阵会附带回合制技能，例如第三回合触发生命回复或伤害吸收效果，这类阵旗适合布置在生存压力较大的武将身上。需注意阵旗无法叠加，同一武将装备多个同类型阵旗仅最高级生效。魂阵升级消耗大量安魂石，建议平民玩家通过日常活动积累资源，避免消耗元宝强行提升。高阶魂阵的阵旗属性加成更高，例如红魂阵的阵旗基础属性优于橙魂阵，应优先解锁高阶魂阵。
